miércoles, 31 de marzo de 2021

SECCIÓN EDUCATIVA

Los  cambios en el nuevo PubMed

Más allá de los cambio en la Interfaz de la plataforma, la principal modernización de PubMed es que se traslada a la nube por lo que han tenido que reconstruir toda la infraestructura.

A continuación, siguiendo las ideas del Blog  Pildoras. Saluteca, son entre otros.   

Cambios generales  

1.     Mejoran el diseño, la visualización y navegación de toda la base de datos, haciéndola más intuitiva.

2.     Los cambios mejoran especialmente la versión móvil de PubMed

Mejoras en las búsquedas y recuperación de resultados

1. La nueva interfaz es más rápida y sencilla de usar ya que incluso, además de por palabras, desde la caja principal de búsquedas podemos directamente:

Buscar por frases

Ejemplo: preventing head lice in schools
Ejemplo: treatment incidental adenocarcinoma

Buscar por citas

EjemploMarrom medicine 2016

Buscar por autor
Ejemplo: Herrera CJ

Buscar por revistas
Ejemplo: Lancet oncol

2. Se mejora el mapeo automático de términos, PubMed ahora:

Incluye los sinónimos y variantes de escritura del inglés
Ejemplo: “Anesthesia” busca además por “anaesthesia” y “anaesthesias”

Incluye las formas plurales
Ejemplo: “lunch” busca además por “lunches” y “lunching”

El truncamiento ilimitado (antes limitado a 600 variantes)
Ejemplo: catal* ahora arroja 575.760 resultados,  antes devolvía 505.237

3. Mejora sustancial del algoritmo que clasifica los resultados por relevancia  (Best match)

Posibilidades de búsquedas

1.     Debajo de la caja principal de búsquedas se accede a la búsqueda avanzada. Al final de esta página se muestra también el historial de búsquedas que incluye ahora los “detalles” de la estrategia de búsqueda que ha efectuado de forma automática PubMed.

2.     Podemos Crear alertas y especificar la frecuencia y el formato en el que la queremos recibir, si tenemos cuenta en NCBI, Google, etc. (desaparece de momento  la posibilidad de generar rss)

  Debajo de la caja de búsqueda:

1.     La opción Save nos permite seleccionar el formato en el que queremos guardar los resultados de la búsqueda o de cualquier artículo.

2.     La opción Email envía los resultados al correo que le indiquemos

3.     La opción “” envía los resultados al portapapeles (Clipboard) que es un archivo temporal donde ir guardando los resultados que nos van interesando, sin necesidad de estar registrado en PubMed. También los puede guardar en My Bibliography o Collections, pero en este caso se debe tener cuenta en NCBY

4.     A la derecha podemos ordenar los resultados por relevancia (Best match) o por fechas, en orden ascendente o descendente

 Cambios en la presentación de los resultados

1.     Debajo del título y en color verde está la línea de la referencia del artículo, que se simplifica con los datos esenciales, e incluye el tipo de artículo, en cursiva, y el PMID

2.     Debajo de cada artículo aparece ahora un fragmento del resumen así como las nuevas utilidades para ver cómo se cita y compartirlo en redes sociales

3.     El nuevo filtro de tiempo permite seleccionar con el cursos el periodo que nos interesa, pero  además ahora  podemos descargar los resultados por años en un archivo csv, para analizar la evolución del término.

 Cambios en la visualización de los registros

 En la parte central

1.     Los artículos similares aparecen ahora debajo del abstract, antes estaban en la página de resultados. Muestra hasta 100 artículos relacionados

2.     Debajo otra novedad Cited by donde podemos ver el número y el enlace a los artículos donde se ha citado el registro seleccionado

 A la derecha

3.     Como en la versión anterior, a la derecha se muestran los iconos de enlaces al texto completo a través del editor o de la biblioteca, para acceder al artículo, si está suscrito, o poder solicitarlo a nuestro centro.

4.     Vuelve a aparecer en botón de Citar, que permite hacerlo en 4 formatos. Si utilizáis gestores bibliográficos y quieres volcar el registro allí hay que seleccionar el formato “Dowload.RIS”

5.     Permite añadir el artículo a Favoritossi tenemos cuenta en NCBI, Google, etc.

6.     Vuelven a aparecer los iconos que nos permiten compartir el artículo en redes sociales o copiar su enlace permanente

7.     Debajo de lo anterior y como una de las novedades principales es la  aparición de la columna de navegación amigable de la página, que nos permite ir a partes concretas del artículo: el MeSH, el Abstract, etc.

8.     Puedes ver e ir al artículo siguiente o al previo desde los botones de “PREv result” o “Next Result” que además carga el contenido con sólo pasar el cursor por encima

Fuente: Pildoras. Saluteca    https://www.blogger.com/u/1/blog/post/edit/7946760580681275848/8617991088189857471?hl=en


A continuación el Nuevo PubMed: Guía Básica donde puede observar  más los cambios.

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El nuevo PubMed. Guía básica 

Elaborado y adaptado por: Carmen Yris Olivo, MLS

Fuente: El blog Pildoras. Saludteca 


I.  ¿QUÉ ES PUBMED Y QUÉ CONTIENE?:

 

El sistema de búsqueda PubMed es un portal web de recursos gratuitos desarrollado y mantenido por el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI), en la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) de los Estados Unidos. 

Permite el acceso a más 32 millones de citas de artículos de revistas desde el año 1960, provenientes de 6,000 de artículos de revistas internacionales de. la literatura biomédica (datos 2020), procedente  primordialmente de la base de datos MEDLINE (Medical Analysis Retrieval Sytem Online)  y en menor medida de otras fuentes, como: PubMed Central (PMC), Bioethics, Cancer, Core Clinical Journals, Dental Journals, Nursing Journals, entre otras.

MEDLINE es la base de datos más importante de la NLM abarcando citas en  los campos de la Medicina, Biomedicina y Ciencias afines, como: Oncología, Enfermería, Odontología, Veterinaria, Salud Pública y ciencias preclínicas, disciplinas relacionadas como las ciencias de la vida, las ciencias del comportamiento, las ciencias químicas y la bioingeniería.  

También incluye referencias de libros, actas de congresos, etc. De igual manera, enlaza con el texto completo de las revistas de acceso gratuito alojadas en la red. Contiene subbases: AIDS, Bioethics,  Cancer, Complementary Medicine, Core Clinical Journals, Dental Journals, Nursing Journals y PubMed Central (repositorio o  archivo digital gratuito de revistas de ciencias biológicas y biomédicas de los Institutos  Nacionales de Salud).

MEDLINE también incluye referencias de libros, actas de congresos, etc. Además, enlaza con el texto completo de las revistas revistas de acceso gratuito en la red.  

Desde el 18 de mayo del año 2020,  oficialmente se lanzó la  nueva versión, por lo PubMed, cuenta ahora con un interfaz de la plataforma. La principal modernización  es que se traslada a la nube por lo que han tenido que reconstruir toda la infraestructura.. Se elabora esta "Guía básica" con el objetivo de orientar a los profesionales de salud de CEDIMAT e interesados a utilizar mejor esta herramienta web. 

Cobertura  temporal:

MEDLINE en su versión actual facilita referencias desde 1966 y anteriores de desde 1940 a través del antiguo  MEDLINE. El acceso gratuito a través de PubMed y se inicia sobre 1996.

 Idioma:

Ofrece información en múltiples lenguas procedente de unos 70 países con predominio anglosajón; de alrededor de un 93 % en inglés. Un 85% de las referencias aportan resumen.

Para conectarse...

Pubmed es de acceso gratuito. El modo de acceder a la misma es a través de la dirección electrónica es: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/ puede conectarse directamente.

Pantalla de inicio

                                              Figura 1: Pantalla de inicio

Fuente: Biblioteca Universidad Complutense de Madrid  https://biblioguias.ucm.es/med-pubmed

Pantalla de "Búsqueda Avanzada

                                          Figura 2. Pantalla de "Búsqueda Avanzada

Fuente: Biblioteca Universidad Complutense de Madrid  https://biblioguias.ucm.es/med-pubmed

Bajo la caja principal de búsqueda en la pantalla de inicio, se encuentra el botón para acceder a la pantalla correspondiente a la búsqueda avanzada. La pantalla "Avanzada" está preparada para combinar múltiples términos creando cadenas complejas de búsqueda.

En ella localizamos: el menú desplegable de campos, la caja de búsquedas "previa" en la que el investigador eliges las vínculos de búsqueda;  la caja principal para buscar cuando la estrategia ya está construida, el botón para buscar, el menú desplegable de operadores booleanos, el historial y el acceso al índice.


II.           ESTRATEGIAS DE BÚSQUEDA


Una estrategia de búsqueda se define como el conjunto de procedimientos y operaciones que que un usuario o un profesional de las ciencias de la salud o biomedicina  realiza con el fin de obtener la información necesaria para resolver problemas clínicos, identificar la información relevante, pertinente y confiable de manera eficiente en la  base de datos MEDLINE.   Permiten dos opciones de búsquedas: Búsqueda básica o sencilla y avanzada.


A.     BÚSQUEDA BÁSICA  O SENCILLA

La búsqueda básica, rápida  o libre, es buscar artículos que tengan la palabra citada. Un claro ejemplo son las búsquedas que realizamos habitualmente en Google.

Para realizar una búsqueda sencilla, introduzca el término o frase en la caja o motor de búsqueda y pulse el botón “search” o la tecla enter.

Permite "explorar" la base de datos y recuperar referencias de forma rápida.

Como en este tipo de búsqueda no se especifica ningún campo en el que localizar la información, el sistema buscará en todo el registro bibliográfico comparando los términos de búsqueda con los índices: MESH (Subject Translation Table), Revistas (Journals Traslation Table) y Autores (Author Index y el Investigator-Colaborator Index); este proceso se conoce como "mapeo automático de términos".

Se aconseja:  Expresar el tema de forma específica; sin estrategias: entrecomillados, truncamientos, operadores, Evitar puntuación, operadores booleanos, etiquetas, etc.etc.

Por varios términos:

Cuando el tema de la búsqueda sólo se puede expresar con una frase, o dos o tres palabras cuando interesa que el sistema recupere la frase exacta, poner entre comilla los términos de búsqueda. Ejemplos: "Cardiovascular imaging”, "Body Image”, "Cardiac Magnetic Resonance”  

Para realizar una búsqueda sencilla por varios términos , introduzca el término o frase en la caja o motor de búsqueda entre comilla  y pulse el botón “search” o la tecla enter.

Figura 3. Búqueda por varios terminos


Truncamiento:

Permite recuparar registros o referencias en los que aparecen términos que derivan de la misma  familia de palabras. Para hacer un truncamiento hay que escribir la raiz seguida de un asterisco al final. Ejemplo: Derma*, recuperará: Dermatology, Dermatitis, Dermatoses, Dermal, etc 

Figura 4. Búsqueda por truncamiento  y resultados 

                               Fuente: Biblioguía PubMed. Biblioteca Universidad Complutense de Madrid.

Por autor:  Ver: Tutorial rápido y ejercicio:

·     Poner el apellido y las iníciales directamente en la caja de búsquedas, sin puntuación, ejemplo:  herrera cj y pulsar el botón "Search". 


Figura  5. Caja o motor de búsqueda básica 

Fuente: PubMed

Ejemplo de resultados de búsqueda básica, por autor. PubMed recupera 30  artículos de herrera cj. 

 Figura 6. Búsqueda básica por autor apellido(s) y  las iniciales del nombre


                           Nota: Si en la referencia aparece Free PMC article, se encuentra en texto completo. 

 

·         Si sólo conoce el nombre y apellido debe usar la etiqueta [au] detrás del apellido, ejemplo: Roa-Sanchez P. [au] y pulsar el botón "Search”


        Ejemplo de resultados de búsqueda: 



Figura 7. Búsqueda por apellido(s)  del autor 




·      Ahora se puede buscar además,  por el nombre completo del autor,  tanto en el orden directo:  Herwin Speckter  (como en el inverso (Specker H.)). Pulsar el botón "Search”

Ejemplo de resultados de búsqueda:


Figura 8. Búsqueda básica por  el nombre completo del autor


·    


Para buscar trabajos de un autor como primer firmante hay que utilizar la etiqueta [au], ejemplo:  Stoeter P. [au] y pulsar el botón "Search". 


En el caso de que el autor comparta nombre con otro, al obtener los resultados podemos pinchar sobre el que queremos y el algoritmo de clasificación mostrará los mejores resultados para ese autor concreto.


Figura 9. Búsqueda básica por autor como  primer firmante  invertido (apellido e iniciales del nombre)



   Por una revista:  Ver Tutorial rápido y ejercicio

 

·     Poner el título completo preferentemente, o el abreviado o el ISSN  directamente en la caja de busqueda, ejemplo: Brazilian Journal of Cardiovascular Surgery, Braz J Cardiovasc Surg,  1678-9741 y pulsar el botón "Search". 


Figura  10. Cómo buscar una revista


Por un autor y una revista:

Poner el apellido y la inicial del autor y el nombre de la revista completa, la abreviatura o el  ISSN, ejemplo: Speckter H,  World Neurosurgery,  1878-8750 y pulsar el botón "Search". 

Ejemplo de resultados de búsqueda 


Figura 11. Buscar por autor, por la revista.



Por cita específica: Ver: Tutorial rápido y ejercicio 

·    Poner el título del artículo o los datos que conozca, autor, revista, año, directamente en la caja de búsqueda, ejemplo:   Closure of Patent Ductus 2020  y pulsar el botón "Search". El

algoritmo que incorpora ofrecerá la mejor coincidencia. 

    Ejemplo de resultados de búsqueda: 


Figura 11. Búsqueda de una cita específica



B. BÚSQUEDAS COMBINADA

Operadores booleanos

Los operadores booleanos se utilizan para construir búsquedas combinadas,  informaciones de diversos campos y se utilizan para poder conectar dos o más términos o palabras en una sola búsqueda cuando accede a PubMed. Los operadores  se escriben siempre en mayúsculas, y se utilizan los siguientes. Ejemplos:

Figura 12. Busquedas  combinadas 


AND: recupera referencias que contengan los dos términos de búsqueda, teniendo en cuenta que deben aparecer en el mismo registro, específica y delimita la búsqueda. Ejemplo: Coronavirus AND Prevention.

OR:  recupera referencias que contengan los dos términos, o al menos uno de ellos. Principalmente se utiliza para localizar sinónimos, variantes, y multiples formas en las que se puede expresar un mismo tema. Ejemplo: Coronavirus OR COVID-19 

NOT: excluye referencias que contengan el término escrito después del operador.  Las referencias que recuperas contienen sólo el primer término, eliminando los que contengan el segundo. Ejemplo: Coronavirus NOT  Rats.

Fuentes: 

 Cómo buscar en PubMed. Guía rápida. Pildoras  https://mariamontanavivas.wordpress.com/2020/05/18/como-+  buscar-en-el-nuevo-pubmed-guia-rapida/ 

  Universidad de Madrid. Biblioteca.  Biblioguia PubMed. https://biblioguias.ucm.es/med-pubmed       


                                            Continuará en el próximo  Boletín ....

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